1870年，法国与普鲁士（德国）之间发生了战争（普法战争）。这是在路易斯从特列斯特回到巴黎后不久的事。

高等师范学校的学生爱国情绪高昂，纷纷志愿从军，所以当时学校里没一个学生，静悄悄的。路易斯的18岁儿子，也到战场去了。

路易斯虽想参加国民军，但由于半身不遂，不能当兵。没有办法为祖国作战，让他感到遗憾。

普鲁士的军势非常强盛，法国军队败了又败。拿破仑三世在9月1日，在色当被普鲁士军俘虏。

势如破竹的普鲁士军队，进逼巴黎。数年前就任高等师范学校副校长的路易斯好友贝尔丹说：“你不能留在巴黎。”他担心路易斯的安全，继续说：“你没有留在巴黎的必要，因为巴黎如果被普鲁士军包围，身体不灵活的你，只是空耗粮食的多余的人，现在该趁早到阿尔布瓦去避难。”

贝尔丹是想让路易斯在安静地方继续研究。路易斯听从贝尔丹的劝告，于9月5日，和家人一起返回阿尔布瓦。

但是，法国的不幸随他后面追来。在远离巴黎的阿尔布瓦，也得不到宁静的生活。为了使镇民收听战况，每当通知的鼓声响起的时候，路易斯就赶快出来，混在人群里，忧虑地倾听公报。

巴黎传来一个接着一个的战况，都是法军战败的不幸消息，路易斯满心的忧虑和苦闷。

法国遭受普鲁士军**的地方，人们纷纷地逃窜，难民在途中成群结队地走着，车子上乱堆着家具、行囊，扶老携幼的人们跟随在后，真是一幅悲惨的画面。

敌军逼近巴黎。巴黎为了准备防卫，到处都是士兵和大炮，街口堆满了沙袋，充满了战争气息。

高等师范学校成为战地医院，被配属于巴黎警备区的高等师范生，负伤了就被送到这里医治。巴黎不久就被包围了，炮弹呼啸而过，敌军的炮兵，竟然不顾红十字的标志，瞄准病院轰击，路易斯听到了这一消息，对普鲁士军的暴行，从心底涌起了无限的愤怒。

德国的波昂大学，曾经在1868年颁赠医学博士学位给路易斯，理由是：“对于有关微生物发生的研究，有极大的贡献，因而促使发酵学进步。”

那时候的路易斯，认为自己的研究影响能为外国学者所认识而感到高兴。现在，对于敌国大学所赠予的名誉，他感到十分厌恶。

1871年1月18日，路易斯决定把医学博士学位证书退回给波昂大学。对于普鲁士军历历可数的残暴行为，巴斯德以这样的方式表示抗议。

6天后的1月24日，路易斯准备去寻找在法国东部与普鲁士军作战的儿子。他的儿子在何地、能不能相逢，这些路易斯都没把握。有如浮萍漂流的旅行，让路易斯和妻子忧形于色。

马车在积雪的道路上行走，摇摆着前进，好不容易，第三天到达了儿子参军时候的城镇，镇内到处是士兵。

路中间生了一堆火，冻得发抖的士兵们围着取暖。有的士兵用破布包着的脚趾都快要掉下来了，实在悲惨得令人不忍多看一眼。

路易斯的妻子走到士兵们附近，打听儿子的行踪，可是没人知道。有一个士兵说：“我能告诉你的是，这一个部队有1200人，而生还的只有200人。”

路易斯妻子感到绝望，战死的人这么多，自己的儿子说不定已经战死了。可是她仍不灰心，在士兵群中边走边一个一个地问。有一个士兵经过旁边的时候，刚好听到了她的话，就停下来反问：“是巴斯德下士吗？”

“是的，你知道他的下落吗？”

“当然知道，我昨天和巴斯德下士睡在一起的。”

“那么，他现在还活着？”

“当然了，只是现在生了病……”

“他现在在哪里？”

“在后方。你们返回的途中就可以碰见。”

“是这样吗！真是太谢谢你了！”

路易斯和妻子刚才紧绷的脸，一下子舒缓多了。

当他们的马车刚要越过城门的时候，与一辆货车交叉而过，货车上有个头戴套帽的士兵，两手抓着车架，当他一眼瞥见路易斯一行的马车，发出了一声惊叫，跳下了马车。路易斯一看到从货车跳下的士兵，立刻吩咐车子停下来。那个年轻士兵正是他们的爱子，3个人相拥痛哭了很久很久。